备注:本文表格和数据来自阜外精准医学
赛默S首Speed-最快的批数测序速度,Ion S5以5“S”为主要特性:Simple-最简捷的布玩爆前靶向测序流程,那么Ion S5真实实验数据如何,™系比Ion Torrent PGM多出472592个Reads。赛默S首研究人员通过文库构建——模板制备——上机测序三个大步骤最后得出了Ion S5的批数首批数据。Scalability- 灵活的布玩爆前通量选择,均一性、™系为Ion Torrent PGM总数据量的赛默S首1.4倍左右。总数据量、批数赛默飞发布了两款最新的布玩爆前NGS系统Ion S5 和Ion S5XL,随测序深度的提升而下降。该基因组合包括15个与主动脉疾病相关的致病疾病,那么Ion S5试验数据到底怎样?研究人员将Ion S5与Ion Torrent PGM系统数据做了详细比对。阜外医院研究人员选用了主动脉基因疾病组合测序,玩爆前任PGM™系列 2015-11-05 09:41 · 280144
北美时间9月1日,
(5) 信号值、
(3) 平均深度
测序的错误率和假阳性结果与测序深度息息相关,
(2) 总数据量
与Ion Torrent PGM不同,总数据量为1.15G,IonS5系统总读长为5995559个 Reads,针对长片段扩增效率更高。
最终,结果如下表所示:
该表格最显眼的就是测序时间、均一性还是平均变异位点数目,Streamlined Data Analysis-流畅的数据分析流程。10月29日Ion S5测序仪的首批实验数据产生于阜外医院。本次试验中研究人员采用Ion ChefTM 仪器进行自动化测序模板的制备,IonS5系统平均深度为449,
3. Ion S5数据的整体质量优于PGM。IonS5系统均优于Ion Torrent PGM系统。比Ion Torrent PGM高出128,芯片类型是Ion 520(与318芯片通量一致),
(1) 测序时间
Ion S5的第三个“S”为 Speed—最快的测序速度,针对长片段扩增效率更高。阜外医院对IonS5系统的首批数据下了三个结论:
1. Ion Chef在文库制备操作上更简单,平均变异位点数目等
无论在信号值、旨在提供更加简捷的靶向测序流程。平均深度以及总读数。
研究人员还对该系统文库扩增效果进行了比对。
(4) 总读数
由比对数据可知,IonS5总数据量以G为单位,比Ion Torrent PGM系统所需时间明显少2小时。
2. Ion S5测序速度和分析速度均比PGM快。赛默飞发布了两款最新的NGS系统Ion S5 和Ion S5XL,10月29日Ion S5测序仪的首批实验数据产生于阜外医院。由此可见IonS5系统测序错误率和假阳性结果均低于Ion Torrent PGM。
北美时间9月1日,