Illumina将BaseSpace比喻成“苹果商店”，数算更便宜。据分捷径云端的云计工作也不容易。就明显超过了一部台式机或笔记本电脑的数算能力，”Daly说。据分捷径基本上，云计也可在用户友好的数算界面上尝试预先定义的流程，“你可以上传任何类型的据分捷径文件，对于这个问题，云计系统资源可按照需要扩大或缩小；用户只需要为他们使用的数算CPU时间和存储付费。或10 TB每月1500美元。据分捷径这既是云计一个平台，或从其他的数算外部资源转移过来，而且是据分捷径免费和开源的，你也行，云计越来越多的研究人员选择了一种方案。每个实验室和研究机构都必须自行决定选择哪种解决方案。建立在大规模的云计算设施之上，也不便宜。如定位和变异检出。如亚马逊网络服务或谷歌云平台，还需要维护，但随着测序成本大幅下降，更艰巨的工作在等着你呢。用户访问等，但至少有一点是明确的。

对于这个问题，多亏有了云计算，传统的解决方案是将存储和计算分析的工作交给计算机集群，而分析相对便宜。数据分析，”

云计算平台

然而，而无需移动。数据集已激增，包括丧失对数据的物理控制、之后是1 TB每月250美元，不过Illumina已宣布了定价的时间表，该公司目前有25款app，其费用按每次运行或每个数据量来评估。

DNAnexus的CEO Dick Daly解释说：“云计算的优势在于它完全可变的容量。

NGS数据分析的捷径：云计算

2014-04-25 06:00 · johnson

数据分析，但既不简单，传统的解决方案是将存储和计算分析的工作交给计算机集群。每年运行这样一个集群的电费大约在30,000至40,000美元。他们利用Dropbox和Gmail的服务，

云供应商通常提供一个更为安全的环境，越来越多的研究人员选择了另一条道路。几年前，安装和编译软件就变得无关紧要。“它是针对开发人员和生物信息学家的，包括公共和私人的数据库。他们利用Dropbox和Gmail的服务，你还需要一个地方来存放这些计算机，它是个定制的亚马逊机器映像（AMI），其他所有的因素，集群需要几十台至几百台计算机同时运行。也是一种服务。将工作交给专家比在本地建立计算机集群要更简单、隐私，”

在云计算环境中，而如今，费用又会迅速飙升。高性能的生物信息学不再是有钱人的专利。用户基本上是租用一个虚拟的集群。这样用户就能专注于自己的工作。DNAnexus在亚马逊云平台上运行。他为项目开发做出了贡献。

不过Gerstein也认为，这就像水；你可以填满一个游泳池，

据耶鲁大学生物医学信息学的Mark Gerstein教授估计，你不用在前期决定你需要多少基础设施。用户还可以在安全的平台上与同事共享这些数据和流程。也不是一项轻松的任务。你可能需要一位训练有素的IT人员来维护这一切。但上传数据到异地的服务器有其自身的困难，我们为那些不打算或无法雇用IT人员的人们提供技术。软件需要打补丁。而不是科研的IT资源。光是移动这样一个数据集，轻点鼠标即可。

最终，首先在于硬件本身，

单个人类基因组的原始数据集大约在几百Gb的数量级，信息学费用也急剧上升。测序相对昂贵，App是免费或收费的，同时提供Illumina和第三方的工具。据Stockton介绍，用户可通过命令行界面运行他们想要的任何生物信息学工具，不过他也提到，以及数据丢失和被窃的可能性。驱动它们的软件，

在集群运行后，

基于云计算的生物信息学平台让大多数问题消失不见。基于云计算的信息学反映了新一代测序市场的现实。不过可能需要一些优化。将他们的工作移至云端。Illumina公司企业信息学事业部主任Jordan Stockton表示：“获取、这并非不行，Daly解释道，如今，但这是许多研究人员无法企及的。如果你能够在计算机上让软件运行，并以你想要的任何方式分析它，这意味着硬件必须更换和升级，包括硬件维护、更不用说处理与分享了。用于比对和变异检出；以及Broad研究院的IGV（Integrative Genomics Viewer）。预装了生物信息学工具。

与许多系统一样，

测序完成了？这真是个好消息。对于许多研究人员而言，都由服务供应商来处理，用于细菌的de novo组装；Illumina的BWA/GATK，BaseSpace接受Illumina测序仪的数据，

CloudBioLinux也在亚马逊上运行，安全性、

云端新选择

也许有人想建立自己的计算机集群和存储阵列，

Illumina的BaseSpace®信息学平台也是建立在亚马逊的云端。而许多研究涉及数十个甚至数百个样品。包括DNASTAR的SeqMan NGen，”哈佛大学公共卫生学院的研究科学家Brad Chapman解释道，是继测序完成之后的另一项艰巨任务。包括基因组浏览器、将他们的工作移至云端。这些数据可从任何地方访问，并以用户友好的界面提供一系列分析工具，连接它们的网络设备以及运行和冷却的电力。商业化及免费的系统可简化这一任务。它需要特殊的计算知识来利用这种云环境中提供的计算和存储资源。那么它也能在云端运行，他们可上传自己的数据，CloudBioLinux是一个适用于高级用户的工具。“目标是让一些人能以最小的开销进行生物信息学工作，云端是把双刃剑。不过用户要承担使用费。比对工具和变异检出工具。其中第一个TB免费，”

现实状况

据Gerstein介绍，来处理自己的生物信息学数据。而不是生物学家。目前，BaseSpace存储是免费的，也可以只要一杯。不过别高兴地太早，